Förutsäger ditt genom ditt ansikte? Inte riktigt ännu

Proceedings of National Academy of Sciences, MIT Technology Review

På måndagen, det kaliforniska genjaktsföretaget Human Longevity publicerade en tidning gör det djärva påståendet att det kan identifiera individer som använder deras genom för att förutsäga hur deras ansikten ser ut.

Påståendet - att ditt DNA kan användas för att skapa en fotoliknande rekonstruktion av dig - har potentiellt stora konsekvenser. Det skulle tillåta polisen att plocka ut misstänkta ur en uppställning med hjälp av en blodfläck och det skulle innebära att inget genom som samlas in för forskning är verkligen privat.

Men en förtvinande reaktion på ansiktsförutsägelsepapperet från forskare på sociala medier är förmodligen inte vad Human Longevitys grundare, den berömda genomikexperten J. Craig Venter, hade i åtanke.

Enligt två experter som granskade tidningen - och en tidigare anställd - kan Venter faktiskt inte välja en person ur en folkmassa med hjälp av ett genom, och hans rapport hade svårt att hitta en utgivare.

Craig Venter kan inte förutsäga ansikten, sa Yaniv Erlich, chief scientific officer för MyHeritage.com, en släktforskningswebbplats, rakt ut på Twitter. För att göra poängen, Erlich Postad Venters förutsägelse av sitt eget ansikte, och noterade att det såg mer ut som skådespelaren Bradley Cooper än biologen som blev entreprenör.

Venters team använde genomdata för att förutsäga ansiktsform, ögon- och hårfärg, och till och med hur din röst låter och smälte ihop dem till bilder som de sa var tillräckligt korrekta för att återidentifiera vems genom det var.

Men skeptiker säger att Human Longevity faktiskt använder en persons ras och kön – lätt mätt från enklare DNA-tester och inte en ny idé – för att skapa bilder som visar genomsnittliga ansikten, inte specifika, som företaget sa.

Relaterad berättelse

Relaterad berättelse Genforskning och datoranvändning i Silicon Valley-stil börjar smälta samman.

Med hjälp av sin metod rapporterade företaget att det kunde välja rätt person från en serie på 20 fotografier ungefär 70 procent av gångerna. Men efter att ha kasserat människor av ett annat kön och ras än ämnet sjönk precisionen drastiskt. Används för att välja en specifik europeisk man ur en lineup av 20 andra europeiska män, var det rätt 11 procent av gångerna.

Ansiktsförutsägelsen är bara att förutsäga det genomsnittliga ansiktet för ditt lopp. Du kommer alltid att säga, 'Wow, den typen av ser ut som jag', säger Jason Piper, en genetikexpert som arbetade på Human Longevity. Piper, som är listad som författare till tidningen men nu är anställd av Apple, tog också till Twitter för att kritisera dess slutsatser som omotiverade.

Höga insatser

Ansiktsstudien var tänkt att visa upp förmågan hos Human Longevity, som har samlat in cirka 300 miljoner dollar för att sekvensera en miljon mänskliga genom. Affärsplanen: skapa den största DNA-databasen på planeten och släpp lös kraften i genomet för att göra hälsoförutsägelser.

Ansträngningen att privat samla geninformation upprepade Venters kontroversiella roll i det ursprungliga Human Genome Project, när han tävlade om offentliga forskare för att slutföra ett första utkast. Hans ansträngning vid den tiden att skapa ett Bloomberg av DNA-data, genom hans tidigare företag Celera, lyckades inte.

Med sin nya satsning hjälpte Venters stora namn och ambition honom att locka till sig stjärnor, som maskininlärningsspecialisten Franz Och , som gick med från Google för att knäcka data. På en Health Nucleus i San Diego började Venter erbjuda ultradetaljerade medicinska undersökningar som kostade så mycket som $25 000. Inkluderat är en genomavläsning och en personlig vetenskaplig affisch som visar en kunds gener.

Ansiktsförutsägelseprojektet genomfördes för att visa värdet av dessa erbjudanden. När allt kommer omkring, om Venter kan skriva ut ditt ansikte från ditt DNA, måste Human Longevitys medicinska utvärderingar vara värt det. Om jag säger till dig att du löper risk att drabbas av hjärtsjukdom och att du behöver ta statiner, hur kan du vara säker? säger Piper. Om [företaget] kan förutsäga hur kunden ser ut, är det en grundsanning för förtroende.

Gissande egenskaper

Inom genetiken kallas egenskaper som färgen på dina ögon eller kolesterolnivåer för fenotyper. Dessa fenotyper bestäms, i större eller mindre grad, av ditt specifika DNA, eller genotyp.

Det är därför det inte bara är teoretiskt möjligt att identifiera någons ansikte från deras DNA, utan sannolikt kommer det att vara möjligt om några år, säger Mark Shriver, som arbetar med förutsägelse av gener till ansikte vid avdelningen för antropologi i Penn State. Jag tror säkert att det ligger i vår framtid, säger han.

Men forskare har fortfarande arbete att göra för att veta exakt hur, säg, ditt DNA påverkar längden på din näsa eller bredden på din mun, eller klangfärgen på din röst. Shriver tycker att Venters papper inte tillförde mycket till vad som redan kan förutsägas med hjälp av befintliga DNA-tester som mäter din etniska makeup och sex.

Att kalla det att förutsäga från genomet är vad som är fel, säger Shriver. Huvudbudskapet är överdrivet. De hade helt enkelt inte tillräckligt med människor för att hitta generna som särskiljer människor. Det här är inte papperet som kommer att övertyga folk om att detta kommer att påverka integriteten eller hjälpa kriminalteknik.

Sekretessfråga

Sedan det startades 2013 har Human Longevity förlorat eller sagt upp flera anställda. Hälften av författarna till den nya tidningen arbetar till exempel inte längre på företaget. Och, Google-stjärnan, hoppade av efter en kort tid för att testa uppstarten GrailBio. Också borta är dess tidigare chefsforskare och informationschef.

En talesman för Human Longevity sa att en sådan omsättning var normal. Som svar på frågor om sitt papper släppte företaget på tisdagen ett uttalande som noterade att dess datauppsättning, baserad på 1 061 personer, inte var extremt stor och att större kohorter skulle behövas för att göra mycket mer exakta förutsägelser och identifieringar.

I sitt uttalande hävdade företaget dock sitt omtvistade påstående: Om du har ett genom från det offentliga området kan forskare skapa en bild av den individen och på så sätt identifiera den personen.

Venters tidning hade inte lätt att hitta ett förlag. Shriver säger att han agerade som recensent av tidningen för Vetenskap , den ledande amerikanska vetenskapliga tidskriften, där den granskades två gånger och slutligen avvisades. Den publicerades istället på måndagen i Proceedings of the National Academy of Sciences .

I pressbevakning av hans resultat, tjatade Venter också på vissa forskare genom att använda ansiktsförutsägelser för att hävda att genomdata – särskilt offentliga data – innehåller en allvarlig ny integritetsrisk. Nämligen, om någon hade tillgång till ditt avidentifierade genom, skulle de kanske kunna länka det till dig genom att generera ett fotografi.

Jag har alltid sagt till folk att ditt genom är mer än alla andra siffror i ditt liv som identifierar dig: ditt kreditkortsnummer, ditt födelsedatum, din adress, ditt personnummer, sa Venter till San Diego Union-Tribune .

Det integritetsargumentet skulle dock kunna ses som egennyttigt, eftersom Venters poäng är att privata databaser, som hans, är mer benägna att erbjuda nödvändiga skydd.

Piper, den tidigare anställde på Human Longevity, säger att han bestämde sig för att tala om tidningen eftersom han inte håller med Venters integritetsargument. Genomics integritet är viktigt. Men det är inte hur man ska närma sig det. Det är inte så att vi inte kan dela. Det är hur man delar utan rädsla, säger Piper. Tidningens övergripande budskap är inget jag håller med om.

Dölj