211service.com
Stoppa bröstcancer med hjälp av AI
Den amerikanska regeringen vill ta reda på om artificiell intelligens kan hjälpa läkare att diagnostisera och behandla bröstcancer mer effektivt.
I ett försök att hitta riktade behandlingar för särskilt invasiva typer av bröstcancer som inte svarar bra på befintliga läkemedel, meddelade försvarsdepartementet denna vecka att det anlitar biofarmaföretaget Berg Health att använda AI för läkemedelsupptäckt. Partnerskapet stöder Vita husets Cancer Moonshot-initiativ för att screena upp till 250 000 patientprover i jakt på nya biologiska indikatorer, eller biomarkörer, för de tidigaste tecknen på cancer. Medan dödligheten i bröstcancer har sjunkit stadigt under de senaste två decennierna, är det fortfarande den näst största dödsfallaren bland cancersjukdomar hos kvinnor i USA, enligt National Cancer Institute.
Under partnerskapet kommer Berg att ha tillgång till DoD:s Clinical Breast Care Project, en bank med 13 600 prover av både frisk och sjuk vävnad från nästan 8 000 patienter.
En Berg-forskare använder en centrifug för att bearbeta prover i företagets labb. Berg har utvecklat en plattform för artificiell intelligens för att snabbt screena patientvävnadsprover för potentiella läkemedelsmål.
Berg kommer att börja med att sekvensera prover från friska givare och de med olika subtyper av bröstcancer, vilket kommer att generera genomisk och annan information om mutationer, proteiner och cellulära processer som finns i cancerceller och friska celler. Dessa data kommer sedan att kombineras med patienternas kända medicinska historia och matas in i Bergs AI-baserade plattform, som kommer att producera olika modeller av frisk och sjuk vävnad med hjälp av biljoner datapunkter. Plattformens algoritmer kommer sedan att hjälpa till att upptäcka mönster – hot spots eller nav – i molekylära signaturer över dessa modeller. Sådana mönster kan representera biomarkörer eller läkemedelsmål.
Berg börjar med data och låter data generera hypoteser – motsatsen till den process som är vanlig i läkemedelsupptäckten, säger Niven Narain, Bergs medgrundare, VD och koncernchef.
Startups inklusive AtomWise, Insilico Medicine och TwoXAR tar liknande tillvägagångssätt och använder specialbyggda AI-plattformar för att eliminera en del av gissningarna som är involverade i traditionell läkemedelsupptäckt.
Narain tror att det finns andra undertyper av bröstcancer som forskare inte har identifierat ännu, och han hoppas att Berg kan hjälpa till att identifiera dessa såväl som läkemedelsmål för kända undertyper. Nyckelbiomarkörer som upptäckts under detta samarbete kan leda till ett blodprov för bröstcancer, en mycket mindre invasiv procedur än de biopsier som krävs idag.
Riktade cancerterapier som bröstcancerbehandlingen trastuzumab, känd som Herceptin, har visat sig otroligt lovande, men de fungerar inte på alla patienter eftersom de är designade för specifika genetiska mutationer i tumörer. Cirka 25 procent av bröstcancerpatienterna har en subtyp som kallas HER2 -positiv sjukdom, som i vissa fall kan behandlas effektivt med Herceptin i dess tidiga skeden. Men inte alla patienter på Herceptin svarar på läkemedlet, en indikation på att andra biologiska faktorer spelar in, säger Narain.
Berg har redan använt sin AI-plattform för att identifiera och utveckla ett experimentellt läkemedel som har potential att bromsa eller vända cancercellstillväxt genom att ändra en drivkraft som tros vara involverad i olika typer av cancer. Undersökningsläkemedlet befinner sig för närvarande i en klinisk fas II-prövning för avancerad bukspottkörtelcancer, i kombination med ett vanligt cancerläkemedel.