Ska vi sekvensera varje cancerpatients DNA?

En startup som heter Strata Oncology säger att de planerar att ge bort avancerade genetiska tester till 100 000 patienter som kämpar med cancer. Men det finns ett vinstsyfte: det hoppas kunna identifiera patienter med specifika sällsynta DNA-fel och styra dem till läkemedelsföretag.





Strata, som grundades förra året och har samlat in 12 miljoner dollar från investerare, säger att det är inrättat att köra 50 000 nästa generations sekvenstester om året. Sådana tester undersöker tumörvävnadens DNA och söker efter mutationer i hundratals gener samtidigt, i hopp om att få fram ledtrådar om vilket läkemedel en patient ska ta.

Liknande tester erbjuds redan kommersiellt till läkare av flera företag, inklusive Foundation Medicine i Cambridge, Massachusetts, och kan kosta $5 000 vardera.

Stratas ovanliga affärsplan att ge bort testerna uppstod som ett sätt att lösa en cancer Catch-22. Eftersom DNA-sekvenstester anses vara experimentella av försäkringsbolag, betalar de inte alltid för dem. Men utan sådana uppgifter har läkemedelsföretagen svårt att hitta patienter för prövningar av nya precisionsläkemedel som riktar sig mot specifika DNA-mutationer.



Syftet med företaget är att dramatiskt påskynda inskrivningen till kliniska prövningar genom att ta bort sekvensering som en barriär, säger Dan Rhodes, Stratas VD och tidigare chef på Thermo Fisher, som säljer sekvenseringsutrustning och förser startupen med maskiner.

Företaget uppstod ur en National Cancer Institute-studie, kallad Match-studien, som sedan förra året har erbjudit gratis biopsier och DNA-tester till patienter runt om i USA. Sedan tilldelar patienterna att få ett av 20 riktade läkemedel baserat på deras tumörs DNA, oavsett om de har hud-, lung- eller hjärncancer.

Det vi försöker ta reda på är [vad som händer] om du ignorerar sjukdomen och bara fokuserar på mutationen, säger Robert Comis, medordförande för ECOG-ACRIN Cancer Research Group, forskningsorganisationen Philadelphia som administrerar Match-studien.



Matchstudien är gratis att gå med: regeringen står för både kostnaden för testerna och biopsier, som kan kosta ytterligare 15 000 USD. Företag tillhandahåller drogerna. Responsen på studien var så stor att läkarna var tvungna att sätta den på paus.

Det finns anekdotiska bevis för att utvecklingen av precisionsläkemedel bromsas av avsaknaden av rutinmässiga DNA-tester. GlaxoSmithKline säger att den var tvungen att testa 11 000 patienter för att hitta bara 23 som den behövde för en studie av ett lungcancerläkemedel. Det läkemedlet var inriktat på en viss DNA-mutation som endast uppträder hos 1 till 2 procent av patienterna. Företaget förutspådde att en stor fas III-studie skulle ta 14 år att hitta tillräckligt med patienter.

Vi måste koka havet, hitta de genetiska populationerna och få dem med i försöken, säger Keith Flaherty, en onkolog vid Massachusetts General Hospital som hjälpte till att leda Match-studien och är också en grundare av Strata.



Cancerbehandlingen genomgår en övergång. Fram till nu har tumörer bedömts utifrån vad en patolog ser genom ett mikroskop. Men det är faktiskt mutationer i DNA som får cellerna att gå på tok. Flera banbrytande cancerläkemedel kräver redan ett genetiskt test, men vanligtvis för bara en enda gen, för att avgöra om patienter ska få det.

Det som fortfarande är omtvistat är om alla patienter ska få en bredare genomsökning av sitt tumör-DNA i ett försök att styra sin behandling. Försäkringsbolagen hänvisar till brist på bevis för att rutinmässiga DNA-tester hjälper. Vi är på väg mot precisionsmedicin. Sekvensering ersätts inte eftersom det inte är bevisat kliniskt, men det är svårt att bevisa utan en stor population av sekvenserade patienter, säger Rhodes.

Debatten om testning har till och med nått Vita huset. Framstående cancerläkare som ger råd till vicepresident Joe Biden, som i år utsågs till att leda ett federalt cancermåneskott, har sagt till honom att Medicare bör betala för genomisk testning av alla tumörer . Det skulle lägga grunden, säger de, för en nationell databas som länkar DNA till hur patienter klarar sig i sin cancerkamp.



En nationell insats, eller en kommersiell sådan som Stratas, kan också bidra till att minska skillnaderna i vem som testas och vem som hamnar i lovande prövningar. Några stora centra, som Mass General, DNA-testar nu varje cancerpatient. Men de flesta amerikaner behandlas på regionala cancercentra där testning inte är rutin. Rhodes säger att hans företag har för avsikt att samarbeta med mindre sjukhus så att de också kan erbjuda DNA-sekvensering till varje patient.

Strata kommer också att behöva träffa överenskommelser med läkemedelsföretag för att tilldela patienter sina studier. Rhodes säger att företaget kommer att få betalt beroende på hur snabbt det kan fylla studierna.

Jag tror att om Strata verkligen kan tillhandahålla tjänsten gratis, kommer det att placera dem i en annan värld som inte har funnits utanför regeringen, säger Comis. Nyckelbudskapet för dessa sällsynta mutationer är att du behöver alla att samarbeta. Barriärerna måste undanröjas.

Dölj