211service.com
Raketbränslet för Bidens Cancer Moonshot? Big Data
Om vicepresident Joe Bidens Cancer Moonshot kommer verkligen att dubbla takten av framsteg i att förebygga, diagnostisera och behandla cancer, kommer det att behövas mycket mer data. Det betyder att det förmodligen kommer att behövas fler arrangemang för datadelning som ett som tillkännagavs vid dagens Cancer Moonshot Summit i Washington, D.C., mellan National Cancer Institute och Foundation Medicine, ett bioteknikföretag som säljer tester som sekvenserar tumörgenom.
För att påskynda framsteg har Biden kallad för mer datadelning och samarbete mellan cancerforskare inom akademi, industri och myndigheter. Foundation, som kommer att ge NCI genomiska profiler av tumörer från 18 000 vuxna, är det första företaget som bidrar till NCI:s nya Genomic Data Commons , en offentlig databas och analysplattform för cancergenomik. De nya uppgifterna fördubblar databasens storlek, vilket är avgörande för Bidens projekt och för president Obamas Precision Medicine Initiative . Det kommer att hjälpa forskare att studera genetiska avvikelser som ses i många cancerformer, och det kan också hjälpa till att leda till nya behandlingsmöjligheter.
Vicepresident Joe Biden leder ett försök att påskynda cancerforskningen.
Innan idag innehöll NCI:s databas sekvenseringsinformation från tumörer från cirka 14 500 patienter med cancer, inklusive kliniska data om hur de svarade på läkemedel. Stora databaser som denna kan hjälpa forskare att bättre förstå cancerns natur och hitta ledtrådar om varför vissa tumörer svarar på droger och andra inte, och varför vissa svarar och sedan återfaller.
Informationen från Foundation är inte så omfattande; den kommer inte att innehålla information om hur patienterna svarade på droger. Icke desto mindre är det ett dramatiskt tillägg till NCI:s befintliga dataresurser, säger Louis Staudt, chef för NCI:s Center for Cancer Genomics . Ju större datamängd, desto större chans att nya saker upptäcks. Genom att mer än fördubbla antalet patienter kommer vi att kraftigt öka databasens förklaringskraft för att förstå cancer, säger Staudt.
Tanken med precisionsmedicin är att använda så mycket biologisk information som möjligt för att säkerställa att behandlingar är mer exakt anpassade till individer och deras sjukdomar. Utmaningen med att göra detta mot cancer är att det är långt ifrån en enda sjukdom – det finns på minst 200 blanketter och många fler subtyper, definierade av specifika abnormiteter i tumörgenom.
Vissa patienter har tumörer med avvikelser som bara ses hos en extremt liten del av personer med den typen av cancer, säger Staudt, och i vissa fall finns det läkemedel som verkar mot de sällsynta cancerformerna. Det kan finnas liknande ovanliga förändringar som ännu inte har hittats och som kan representera nya mål för droger. Genom att lägga till fler patienter till NCI:s databas ökar dess förmåga att hjälpa till att upptäcka dem.
Staudt hoppas att donationen från Foundation Medicine kommer att inspirera andra grupper till liknande åtgärder med datauppsättningar som skulle vara värdefulla för cancergenomik. NCI kommer också att generera sina egna nya data genom innovativa kliniska prövningar som NCI-MATCH , vilket är fokuserat på att testa riktade terapier på ett stort antal patienter vars tumörer innehåller specifika abnormiteter.
Det som helst behövs är en samling som inkluderar både stora mängder patientsekvenseringsinformation och detaljerad klinisk information, särskilt om behandlingsresultat, säger Clifford Hudis, VD för American Society of Clinical Oncology. Det innebär att läkarna måste förbättra sin datainmatning i journaler och att uppgifterna måste kunna läsas av datorer, säger han.
Men att sammanföra denna typ av information kommer också att kompliceras av oro för patienternas integritet och lagar som reglerar delning av sådan data. Och kommersiella enheter kommer inte alltid att vara villiga att ta del av sin data. Foundation säger att det har gjort det i det här fallet för att påskynda precisionsmedicin. Kanske ger det här oss en rivstart, säger Hudis.