211service.com
Med Patent Suit ser Illumina ut att tämja den nya brittiska rivalen Oxford Nanopore
Gensekvenseringsjätten Illumina är som genomålderns standardolja. Förutom istället för olja pumpar den DNA.
Mer än 90 procent av all DNA-data genereras av maskiner som Illumina säljer, och företaget i San Diego vill behålla det så.
Det förklarar varför Illumina idag sa att de skulle försöka blockera kommersiell försäljning av ett störande nytt DNA-sekvenseringsinstrument utvecklat av en högtflygande brittisk rival, Oxford Nanopore.
I en patentprocess och ett separat klagomål till U.S.A. International Trade Commission sa Illumina att det brittiska företagets banbrytande DNA-sekvenseringsenheter innehåller stulna idéer och borde stoppas vid hamnen.
Från och med 2014 började Oxford leverera en ny typ av nanopor-DNA-sekvenserare som analyserar DNA genom att dra molekylerna genom en liten, känslig por (se Radical New DNA Sequencer Finally Gets into Researchers’ Hands). Varje kombination av de genetiska bokstäverna A, G, C, T producerar en förändring i elektrisk ström när den rör sig igenom, vilket gör att molekylen kan läsas.
Illumina säger att det kontrollerar patentet på poren som Oxford använder, något Oxford förnekar. Men den större kampen handlar om teknikplattformar och huruvida nanoporesekvensering kan förskjuta Illuminas maskiner eller inte.
Illuminas instrument i kylskåpsstorlek är snabba och exakta (se Varför Illumina är nummer ett). Men eftersom det fungerar annorlunda är Oxfords MinION, som enheten kallas, tillräckligt liten för att vara bärbar (den är ungefär lika stor som en mobiltelefon) och läser upp mycket långa DNA-sträckor.
En nanopore DNA-sekvenserare som säljs av Oxford Nanopore drivs av en USB-anslutning.
Även om den är långsammare och mindre exakt än Illuminas instrument, hotar nanopore-tekniken att bli en konkurrent när forskare hittar helt nya tillämpningar för den som att sekvensera ebolavirus och diagnostisera patienter från ett provisoriskt labb i Guinea .
På sin blogg kallade Mick Watson, en genforskare vid University of Edinburgh som använder båda teknikerna, stämningarna otroligt nedslående och sa att det för forskare var som att ha två av dina vänner slåss.
Faktum är att de två företagen har sparring sedan 2012 efter bryta planer att gemensamt utveckla ett nanoporinstrument och bli rivaler.
I ett uttalande sa Oxford Nanopores vd Gordon Sanghera att stämningarna var utan merit. Han skämtade att det är glädjande att få den kommersiella relevansen av Oxford Nanopore-produkter så offentligt erkänd av marknadsmonopolisten.
Oxford har inte rapporterat några försäljningssiffror men företaget har sagt att mer än 1 000 forskarteam använder MinION.
Oxford är betygsatt Storbritanniens mest spännande – och mest värdefulla – snabbväxande teknikföretag. Det är redan värt cirka 970 miljoner pund, eller 1,4 miljarder dollar, och är planerar en börsnotering , enligt Sunday Times .
Hittills står Oxfords enheter för en del av marknaden för snabbsekvenseringsmaskiner, kemikalier och mjukvara, som är värd 3-4 miljarder dollar per år, enligt Shawn Baker, medgrundare av AllSeq, ett genomikkonsultföretag.
Eftersom Oxford ännu inte är någon kommersiell närvaro, säger Baker, handlar Illuminas stämningsansökan om att skydda deras utrymme och orsaka huvudvärk för Oxford när de försöker bli offentliga.
Illumina har aggressivt försvarat sin gräsmatta, skickligt med prissänkningar, stämningar och förvärv för att behålla sin marknadsposition. 2012 det till och med öppnade eld mot en av sina största kunder , den kinesiska forskningsverksamheten BGI , efter att den organisationen förvärvat en konkurrerande teknologi.
Bakterier använder naturligt proteinporer för att flytta näringsämnen till sina cellkroppar. Men porerna är väldigt ömtåliga, och det tog Oxford 10 år att lära sig hur man smälter ihop dem till en fysisk enhet som kunde läsa DNA.
Oxford har aldrig offentligt avslöjat exakt vilken por som finns i sina maskiner - företaget säger att det är en affärshemlighet. Men enligt Illuminas stämningar är det mer sannolikt att MinION än inte använder en por utvecklad av Jens Gundlach, fysiker vid University of Washington och medarbetare vid University of Alabama.
Fram till Gundlachs verk, publicerat med början 2010 och senare licensierat av Illumina, hölls nanopore-sekvensering upp av tekniska problem. Men Gundlach fann att en trattformad por från bakterierna Mycobacterium smegmatis (så kallat för att det finns i könsdel sekret) producerade en signal som var cirka 10 gånger starkare än tidigare porer, enligt Illuminas patentkostym, som båda universiteten anslöt sig till.
I sin kostym säger Illumina att många bevis tyder på att Oxford använder förbättrade versioner av den poren i MinION.
Genom att be amerikanska handelstjänstemän att undersöka Oxford och eventuellt hindra import av MinION till USA, kan Illumina reta forskare, eftersom ingen jämförbar teknologi finns tillgänglig. Illumina har aldrig annonserat planer på att sälja en egen nanoporprodukt.
Illuminas advokater – Fish & Richardson i Washington, D.C. – noterade att den bredare allmänheten inte skulle skadas om MinION stoppades vid tullen och förbjöds att komma in i USA. Illumina kan fylla alla tomrum med sina egna produkter, säger de.