211service.com
Genvariant kopplad till hjärtsjukdom
Två konkurrerande team av forskare har identifierat samma genetiska variant, belägen på mänsklig kromosom 9, som ger en 40 till 60 procent ökad risk för hjärtsjukdom i de studerade populationerna.
Hjärtsjukdomar är den vanligaste dödsorsaken i världen. Eftersom det är en så vanlig sjukdom var folk oroliga att det skulle vara svårt att hitta genetiska varianter som predisponerar för det, men nu har vi det, säger Kari Stefansson, en av teamledarna och VD för Islands DeCode Genetik , som har varit en nyckelspelare i strävan att identifiera sjukdomsgener. DeCode-forskarna, säger Stefansson, hittade en genetisk variant som predisponerar människor för tidig hjärtinfarkt hos män under 50 och kvinnor under 60.
Rötterna till hjärtsjukdomar är komplicerade eftersom det finns både genetiska och miljömässiga komponenter. Cigarettrökning fördubblar till exempel risken för hjärtinfarkt. Den nya forskningen tyder på att de cirka 25 procent av kaukasierna som har ärvt två kopior av riskvarianten har en 40 till 60 procents ökad risk för hjärtsjukdom, jämfört med någon som inte bär varianten alls. Det är en väldigt stor riskfaktor … nästan upp till rökningsnivån och lite högre än förhöjt kolesterol, säger Stefansson.
Det andra teamet av forskare, ledd av Ruth McPherson , chef för lipidkliniken och lipidforskningslaboratoriet vid University of Ottawa Heart Institute, i Kanada, och Jonathan Cohen , en genetiker vid University of Texas Southwestern Medical Center, i Dallas, fokuserade sin sökning på svåra, för tidiga fall av hjärtsjukdom som drabbade före 60 års ålder. Båda rapporterna visas i 4 maj-numret av tidskriften Vetenskap .
Även om hjärtsjukdomar är mycket ärftliga, säger McPherson, var de genetiska variationerna som ökade sjukdomsrisken i stort sett okända. För detta ändamål kastar båda teamen ett brett nät genom att använda hela genomassociationsstudier för att identifiera genetiska riskfaktorer. Metoden involverar screening av DNA från två grupper av individer – de med kranskärlssjukdom och friska kontroller utan tecken på sjukdom – mot en samling vanliga genetiska variationer som kallas single nucleotide polymorphisms (SNP). Forskarna söker sedan efter särskilda SNP som är associerade med sjukdomen oftare än inte.
McPhersons team använde DNA-prover från fyra olika populationer, bestående av totalt 23 000 individer, och screenade dem med cirka 100 000 SNP. Forskarna upptäckte ett starkt samband mellan två av dessa genetiska varianter på kromosom 9 och risken för tidig hjärtsjukdom. Forskare vid DeCode genomförde en skanning med högre upplösning med hjälp av cirka 300 000 SNP och fem populationer, totalt 17 000 individer, och identifierade tre SNP med signifikanta band till hjärtsjukdomar.
Oavsett skillnaderna mellan studierna är de grundläggande fynden desamma, betonar både McPherson och Stefansson.
Forskarna räknar med att identifieringen av varianten kommer att leda till nya DNA-baserade diagnostiska tester som kan identifiera unga människor med hög risk för hjärtsjukdom. Med ett nytt test kan läkare potentiellt välja ut de högriskpatienter som skulle dra mest nytta av livsstilsförändringar och droger som aspirin, statiner och liknande. Det här är en sjukdom som det finns bra förebyggande terapier för, säger McPherson.
Den nyligen identifierade genetiska riskvarianten är egentligen inte en gen; snarare är det ett segment av DNA som faller i närheten av två gener som tidigare var inblandade i cancer. Vår erfarenhet är att nästan alla dessa varianter som disponerar för folksjukdomarna inte finns i generernas kodande sekvens, säger Stefansson. De ligger utanför den kodande sekvensen och påverkar uttrycket. Jag är inte förvånad över att hitta dem en bit bort från gener.
Bara den senaste veckan har placeringen av riskvarianten blivit en het punkt i arvsmassan. Fyra oberoende team, inklusive DeCode, publicerade rapporter som kopplade samma region på kromosom 9 till diabetes.
Jag tycker att det här är fantastiskt, säger Francis Collins, chef för National Human Genome Research Institute, i Bethesda, MD, och ledare för ett av de fyra teamen, under ett seminarium om genomomfattande associationsstudier. Detta är som sätet för genomets själ. Det verkar som att det här stället bär all den vikten för två mycket vanliga och mycket farliga sjukdomar.