Genomstudie förutspår DNA från hela Island

VD:n för ett isländskt genjaktsföretag säger att han kan identifiera alla från det landet som har en dödlig cancerrisk, men har inte kunnat varna människor för faran på grund av etiska regler som styr DNA-forskning.

Kartor visar hur vanliga vissa riskorsakande DNA-mutationer är runt Island.

Företaget, DeCode Genetik , baserat i Reykjavík, säger att det har samlat in fullständiga DNA-sekvenser på 10 000 individer. Och eftersom människor på ön är nära släkt, säger DeCode att det nu också kan extrapolera för att exakt gissa DNA-sammansättningen av nästan alla andra 320 000 medborgare i det landet, inklusive de som aldrig deltagit i dess studier.

Det väcker komplexa medicinska och etiska frågor om huruvida DeCode, som ägs av det amerikanska bioteknikföretaget Amgen, kommer att kunna informera allmänheten om de löper risk för dödliga sjukdomar.

Kári Stefánsson, läkaren som är grundare och vd för DeCode, säger att han är orolig för mutationer i en gen som heter BRCA2 som förmedlar en kraftigt ökad risk för bröst- och äggstockscancer. DeCodes data kan nu identifiera cirka 2 000 personer med genmutationen över hela Islands befolkning, och Stefánsson sa att företaget har varit i förhandlingar med hälsomyndigheter om huruvida de ska varna dem.

Vi skulle kunna rädda de här människorna från att dö i förtid, men det är vi inte, för det har vi som samhälle inte kommit överens om, säger Stefánsson. Jag tycker personligen att det är ett brott att inte rädda människor med dessa mutationer. Detta är en enorm risk för ett stort antal människor.

Det isländska välfärdsministeriet sa att en särskild kommitté hade bildats för att reglera sådana tillfälliga fynd och skulle föreslå regleringar i slutet av året.

Kári Stefánsson

Tekniken som används av DeCode för att förutsäga människors gener ger ledtrådar till framtiden för så kallad precisionsmedicin i andra länder, inklusive USA, där president Barack Obama i år uppmanade forskare att sammanställa en gigantisk databas med en miljon människor (se USA för att Utveckla DNA-studie av en miljon människor). En tillräckligt stor amerikansk databas skulle också kunna användas för att sluta sig till gener från människor om de hade anslutit sig till den eller inte, säger Stefánsson, och skulle kunna väcka liknande frågor om huruvida och hur man rapporterar hälsorisker till allmänheten.

Den här tekniken kan appliceras på vilken befolkning som helst, säger Myles Axton, chefredaktör för Naturgenetik , tidskriften där DeCode idag presenterade några av sina resultat. Han sa att den lilla öns detaljerade genealogiska uppgifter är anledningen till att den först uppnåddes på Island.

Olika juridiska och etiska hinder hindrar för närvarande DeCode från att varna personer som är i riskzonen. Volontärer som registrerade sig för DeCodes studier lovades anonymitet, och även att de inte skulle få reda på forskningsresultat. Bioetiker inser att människor har rätt att inte känna till genetiska faror, vilket innebär att de inte bara kan få veta.

Regeln är att man bara får använda och exponera genetisk data om man har tillstånd från personen i fråga, säger Gísli Pálsson , en antropolog vid Islands universitet. Men detta är bortom informerat samtycke. Människor är inte ens med i studierna, de har inte lämnat in något samtycke eller ens ett prov, ändå hävdar företaget att de har kunskap om dessa personer och att det finns en hälsorisk.

Pálsson säger att traditionella föreställningar om medicinsk etik nu står i öppen konflikt med precisionsmedicinens mål och möjligheter. Han tror att sådana standarder kommer att behöva justeras på grundläggande sätt i framtiden, så att större vikt läggs vid folkhälsofördelar framför individuella integritetsrättigheter.

Den förväntade livslängden för kvinnor med BRAC2-mutationen är 12 år mindre än för kvinnor utan den eftersom 86 procent av de som har den kommer att utveckla cancer. Män drabbas också eftersom mutationen ökar risken för prostatacancer. Stefansson säger att många av dessa dödsfall kan undvikas genom förebyggande kirurgi, som en mastektomi.

Vi skulle på Island, med en knapptryckning, kunna hitta alla kvinnor med en mutation i BRCA2-genen, säger Stefánsson. Det är ett litet litet exempel på vad du kan göra. Du kan använda detta i förebyggande medicin som aldrig förr.

DeCodes data kan också kunna förutsäga vem i befolkningen som har förhöjd relativ risk för Alzheimers sjukdom eller vem som har en odiagnostiserad inlärningssvårigheter.

DeCode startades 1996 med idén att koppla DNA-forskning till Islands nationella hälsosystem (se Population Inc.). Landets situation är unik på grund av dess noggrant förda genealogiska register, som går tillbaka till 800-talet, när ön bosattes. Det betyder också att de flesta islänningar åtminstone är avlägsna kusiner.

DeCode har genererat grova genkartor, kallade genotyper, på cirka 150 000 islänningar. På senare tid har framsteg inom DNA-sekvenseringsteknologi gjort det möjligt för den att erhålla fullständiga genomsekvenser av cirka 10 000 personer, säger Stefánsson, eller ungefär en av 30 islänningar. Resultat från de första 2 636 fullständiga genomen rapporterades av företaget idag i Naturgenetik .

Kombinerat med genealogiska tabeller är dessa data det som gör att DeCode kan tillskriva genomen från nästan alla födda av isländska föräldrar. Det beror på att när det fullständiga genomet för vissa personer i ett släktträd är känt, kan man sluta sig till de andras gener.

Sean Harper, chef för FoU på Amgen, kallar DeCodes förmåga att gissa människors DNA för en gåta. Han säger att det inte är ett obekant problem för genetiker, eftersom rutinmässiga DNA-tester av en person ofta avslöjar information om nära släktingar. Men det har aldrig tidigare inträffat på en hel nations nivå.

Det är en gråzon ur ett bioetiskt perspektiv, men vi skulle vara benägna att tillhandahålla data eller åtminstone ett meddelande, säger Harper. Han säger att Amgen, som använder geninformation från DeCode för att vägleda sin läkemedelsforskning, inte hade några planer på att debitera någon för riskinformationen som den har utvecklat. Det skulle inte vara lämpligt [att] försöka göra det till en kommersiell process, säger han.

USA saknar en liknande nationell databas, även om vissa privata företag, som 23andMe och Ancestry.com, har genererat grova genkartor över flera miljoner människor totalt. National Institutes of Health planerar att spendera miljoner under de kommande åren på att samla in fullständig genomdata på tiotusentals människor.

Det betyder att hela världen snart kommer att möta samma typer av etiska dilemman som Island nu står inför, säger Pálsson. Har du rätt att pilla med människors liv i stor skala? Du kan säga till din granne: 'Du röker för mycket.' Men det är en annan sak att närma sig 1 000 personer och säga: 'Du har BRCA2-mutationen', säger han.

Dölj