211service.com
Cancers 'World Wide Web'
I flera år har kliniker och datavetare i USA och utomlands försökt förbättra cancervården – från diagnos till behandling – genom att bygga stora, sammankopplade databaser fulla av patientinformation. De kallar dessa förråd för medicinska rutnät och föreställer sig den dag då en läkare i Strasbourg eller New Delhi till exempel kan se att en otydlig bild av en patients lunga är mycket lik den hos en San Francisco-patient, vars fallhistoria skulle kunna vara avgörande för beslutet. att göra en biopsi.
Dessa nya databaser inkluderar inte bara patienternas medicinska historia, inklusive sådana data som MRI och CT-skanningar, utan också information om hur de har svarat på droger. Men fördelarna med dessa underbyggda nät har varit långsamma att komma, dels på grund av tekniska problem och dels på grund av att federala integritetsregler gör datadelning svårt. Nu kan ett National Cancer Institute-projekt testa ett multisjukhussystem för att jämföra lungcancerbilder redan i år - ett tydligt steg mot att använda rutnät.
Den här historien var en del av vårt marsnummer 2006
- Se resten av frågan
- Prenumerera
Kenneth H. Buetow, chef för institutets Center for Bioinformatics i Bethesda, MD, kallar det ett avgörande första steg mot en World Wide Web av cancerforskning.
Under det senaste året eller så har Buetow och hans team samlat in mer än 50 000 bilder av lungcancer som erhållits från medicinska prövningar och arkiverat dem i ett säkert elektroniskt arkiv hos NCI. Deras insats är en del av ett treårigt pilotprojekt på 60 miljoner dollar som lanserades 2004, som involverar 50 cancercentra och mer än 600 forskare. Arkivet finns nu tillgängligt på Internet kl http://ncia.nci.nih.gov . Förutom andra bildprojekt, innehåller den en stor samling lungcancerfall som följts under hela behandlingen.
Med databasen nu till stor del på plats är testning nära förestående. Bildsamlingen är tänkt att uppmuntra och underlätta forskning kring ny programvara som automatiskt kan jämföra bilder av lungor med de som redan finns i databasen. I sådan programvara kommer algoritmer att söka efter gemensamma drag och bygga en katalog med de troligaste matchningarna. Kliniker på kontor och sjukhus kommer att kunna kontrastera de resulterande lungbilderna med de skanningar de behöver för att utvärdera.
Att jämföra bilder är bara det första steget. Om allt går bra hoppas National Cancer Institute inom tre år genomföra en eller flera kliniska prövningar där en stor mängd medicinsk data om lungcancer – inklusive bilder, typer av tumörer, läkemedelsförlopp, patientresultat, till och med de molekylära profilerna för sjukdom – skulle användas av läkare som studerar specifika fall. Resultaten av dessa fall skulle jämföras med de av fall som behandlats genom konventionella metoder för cancerdiagnostik. Den jämförelsen borde ge information inte bara om patienternas medicinska svar utan också om den noggrannhet med vilken läkarna ställde sina diagnoser, och till och med i vilken grad de höll sig till standarder för medicinsk integritet.
Medicinska nätforskare har inte brist på syn. Att jämföra bilder är bara det första steget. I de fall där skanningarna matchar hoppas läkarna kunna gå djupare in i historien om liknande fall och lära sig vilka läkemedel eller operationer som fungerade bäst. Och Buetow säger att hans försök faktiskt kan påskynda dagen då vissa cancerdiagnoser är automatiserade. En läkare kan mata in bilder (och när rutnätet expanderar, blodprovsresultat, beskrivningar av genetiska markörer och andra patientdata) och lära sig hur ofta nästan identiska testresultat från patienter runt om i världen korrelerar med specifika maligniteter som lymfom, melanom, eller sarkom.
Och i framtiden, när kostnaderna för gensekvensering minskar, kan NCI:s rutnät till och med inkludera patienternas genomisk information. Kraften i nätet ligger i dess förmåga att aggregera och korrelera mer och mer folkhälsodata från hela världen, säger Mary Kratz från University of Michigan Medical School, en teknisk rådgivare till nätforskningssamhället. Ju mer data du har, desto mer kunskap genererar du.
Samtidigt måste vardagliga tekniska problem lösas.
Eftersom data som åtföljer bilder varierar i typ och format från sjukhus till sjukhus, utvecklar forskare standardformat som kan harmonisera dem alla. Vi ber forskare vid många konkurrenskraftiga institutioner att riva hinder för att dela stora mängder data, säger Howard Bilofsky, senior fellow vid Center for Bioinformatics vid University of Pennsylvania, som deltar i NCI:s projekt. Att kunna dela information i rutnät över hela världen inom biovetenskaplig forskning är inte något som är lätt att göra.