211service.com
Baser till byte
Kostnaden för att sekvensera mänskliga genom sjunker - i de mest avancerade genomikcentren faller den fem gånger snabbare än kostnaden för datorer. Allt fler människor får sitt DNA sekvenserat av företag och forskningslaboratorier i jakten på ledtrådar om genetisk variation och sjukdom.
Men branschen måste ta reda på hur man billigt lagrar all resulterande data. Vart och ett av de 3,2 miljarder DNA-basparen i ett mänskligt genom kan kodas av två bitar – 800 megabyte för hela genomet. Men betydande data handla om varje bas samlas vanligtvis in, och gener sekvenseras ofta många gånger för att säkerställa noggrannhet, så det är vanligt att spara runt 100 gigabyte när man sekvenserar ett mänskligt genom med en maskin tillverkad av industriledaren Illumina. Att behålla så mycket data om varje person på planeten skulle kräva ungefär lika mycket digital lagring som var tillgänglig i hela världen 2010.
Den här historien var en del av vårt majnummer 2012
- Se resten av frågan
- Prenumerera
Tricket blir alltså att spara mindre. Harvard-genetikern George Church säger att så småningom kommer bara skillnaderna mellan ett nysekvenserat genom och ett referensgen att behöva lagras. Den informationen kan kodas i så lite som fyra megabyte. Då kan ditt arvsmassa bara vara ännu en e-postbilaga.
Informationsgrafik av Infographics.com
