AI kan varna forskare där CRISPR kan göra ett misstag

Kategori: Bioteknik Postad 10 jan

Microsoft har byggt ett verktyg för artificiell intelligens som förutspår noggrannheten av CRISPR så att forskare kan undvika att göra felaktiga redigeringar i DNA.

Saknar målet: CRISPR använder två komponenter: ett skärprotein och ett guide-RNA som leder det till den del av ett genom du vill skära. Guide-RNA:t är cirka 20 bokstäver långt. Problemet är att flera platser i ett genom kan ha samma serie av bokstäver, så CRISPR kan klippa av fel sektion - känd som en off-target effekt.

Varför det är viktigt: Effekter utanför målet är ett av de största säkerhetsproblemen med CRISPR. Att göra felaktiga nedskärningar i ett arvsmassa kan till exempel slå på en cancerframkallande gen.

Hur AI hjälper: Microsofts verktyg låter forskare koppla in en gen som de vill modifiera och få en uppskattning av hur dåliga potentiella effekter utanför målet kan vara. Med hjälp av verktyget kunde forskare ta reda på vilka gener som är svårast att redigera på ett säkert sätt och undvika att justera dem, säger Nicolo Fusi från Microsoft Research.