$1 000 genom på två timmar till 2012, säger VD för Ion Torrent

Det mytiska genomet på 1 000 dollar är nästan över oss, sa Jonathan Rothberg, VD för sekvenseringsteknikföretaget Ion Torrent, vid MIT:s Emerging Technology-konferens. Om hans förutsägelse går i uppfyllelse kommer det att representera en häpnadsväckande triumf i den snabba tekniska utvecklingen. Den hastighet med vilken genomsekvensering har blivit mer överkomlig är snabbare än Moores lag . (Du kan läsa en Q&A BARN gjorde med Rothberg tidigare i år här , och en profil på hans företag här ).

Jonathan Rothberg, chef för Ion Torrent, talar på EmTech 2011

Vid den här tiden nästa år sekvensera mänskliga genom lika snabbt och billigt som bakteriegenom, sa Rothberg. (Tidigare hade han kommenterat att hans företag nu kan göra ett helt bakteriegenom på cirka två timmar.)

Jag var i rummet den 19 oktober när han sa det, och jag skulle ha trott att det var ren hybris om det inte vore för Rothbergs otroliga meritlista på det här området, från att grunda det framgångsrika sekvenseringsföretaget 454 Life Sciences från tidigare generationer till de senaste genombrotten som gjorts med samma teknik som han föreslår kommer att få oss till genomet på 1 000 dollar.

Denna teknik, som kallas, kallas Personal Genome Machine , används redan för att fastställa vilka mutationer som finns i genomet av patienternas cancer .

The Personal Genome Maker dyker redan upp i kliniska labb, till och med läkarmottagningar

Nyckeln till detta genombrott, säger Rothberg, är att PGM inte förlitar sig på konventionell våtkemi för att sekvensera DNA. Istället fungerar det nästan helt igenom konventionell mikrochipsteknik , vilket innebär att Ion Torrent utnyttjar årtionden av investeringar i konventionella transistorer och chips.

Så hur ser åldern på $1 000 genomet ut? Tills vi vet vad fler av dessa gener faktiskt korrelerar med, för de flesta av oss kommer det inte att vara så annorlunda än nuet.

Just nu har inte så många korrelationer mellan dessa 3 miljarder baspar [av det mänskliga genomet] och resultat eller mediciner, säger Rothberg. Han förutspår att det kommer att ta minst 10 år av kliniska experiment med full genomsekvensering för att få oss till den punkt där vi kan börja låsa upp dess värde.

Och det kommer att dröja 20 år innan vi förstår cancer på samma nivå som hiv och kan komma på kombinationer av medicin [skräddarsydda] för varje individ, säger Rothberg.

Du kan se en fullständig video av hans föredrag på Tech Reviews EmTech-webbplats.

Dölj